當天會議部署整改審計查出的預算執行等問題，推動國家重大政策措施落地見效。此前，2016年度中央預算執行和其他財政收支審計結果已向社會公布。李克強明確要求各有關部門，要針對審計查出的政策不落實、資金使用不規范等問題，分門別類推進整改攻堅。
“政府要勇于揭示自己存在的問題，但更重要的是怎么解決這些問題。”總理說，“要把審計中發現的問題分解到各部門，限時按項逐條推進嚴肅整改！審計署要對整改結果進行跟蹤督查！”
審計署負責人在匯報中介紹了審計中發現的一些具體問題。例如，至2017年3月底，電力安全培訓機構資格認可、信息系統工程監理工程師資格認定等21項審批認證等事項未按要求取消下放；基本醫療保險定點零售藥店資格審查等11項行政審批和中介服務事項下放或取消后，未能有效承接或監管未及時跟進。
“這些改革都是激發市場活力并獲得社會廣泛擁護的，也是經過反復論證、國務院常務會議討論通過的，必須進一步加大工作力度，推動各項措施落地落實！”李克強強調。
也有一些審計發現的問題相對復雜。有關部門負責人匯報稱，在營改增改革推進中，隨著增值稅可抵扣范圍擴大，有的行業或企業出現增值稅進項與銷項稅率“倒掛”，導致新增進項留抵稅額超過銷項稅額，從而壓占企業資金。
“這種問題本來不應該發生，但我們這么大的國家，要推進增值稅改革，確實可能因為經驗不足出現預想不到的問題。”總理說，“有關部門要按照‘問題導向’原則，抓緊研究出臺相應措施，確保各行業稅負只減不增！”
當天會議決定，要以整改為契機加快推進“放管服”和營改增等改革措施落地，抓緊落實化解過剩產能、脫貧攻堅、生態環保等方面的政策和項目。同時強化“三公”經費和扶貧、醫保等民生領域資金管理，加強重點領域監管和風險防控，嚴防公共資金“跑偏”或沉淀。
李克強要求，有關部門不僅要下決心堅決糾正各種焦點問題、復雜問題，更要加大整改督查力度，對整改不力和不作為、亂作為的要嚴肅問責，堅決杜絕整改造假行為。
“如果問題確實比較復雜，需要更長時間整改，也一定要講清楚原因。決不能沒整改完說整改完了，結果是錯上加錯！”李克強加重語氣說，“審計就是要動真的，我們整改的結果也一定要是真實的！”
按照規定，有關部門、單位和地方的整改結果要于10月底前報告國務院，并在向全國人大常委會報告后向社會公開。李克強最后強調，各地方、各部門負責人都要“把時間節點趕在前面”，限時辦結各項整改工作。
